在纳格尔斯曼入主拜仁之后，拜仁高层对年轻的纳格尔斯曼一直非常支持。德国媒体Sport1记者Kerry Hau报道了拜仁和纳帅的情况。报道称，拜仁高层对纳格尔斯曼的各个要求都尽量满足，不论是引援，助教人选还是队内设施。

德国媒体Sport1记者Kerry Hau的消息称，尽管最近纳格尔斯曼和诺伊尔发生分歧，不过纳帅依然得到拜仁高层的完全信任，拜仁高层一个接一个满足纳帅的愿望。最近的例子是，拜仁签下了纳帅在霍芬海姆时期的好友、门将教练雷西纳。报道称纳帅已经为签下雷西纳努力了几个月。

现在在入主拜仁一年半之后，纳帅已经有了自己的团队，教练组的工作人员几乎都是纳帅的熟人。比如分析师格吕克，助教托普穆勒和赞布罗德以及心理咨询师佩尔卡，再加上新签下的门将教练雷西纳。现在拜仁教练组只有体能教练布罗伊希是纳帅上任之前的老员工。

拜仁高层对纳帅的支持竭尽全力，包括基础设施的改造以及高科技的培训设施等，报道称自从瓜迪奥拉以来，还没有哪一名教练在拜仁得到如此多特权。

另外纳格尔斯曼还密切参与球队的计划，纳帅最重要的联系人是萨利哈米季奇和内佩。两人都在确保纳格尔斯曼拥有更加灵活战术阵容方面起到了关键作用，现在拜仁有了很多不同类型的球员。

纳格尔斯曼也亲自参与转会谈判，或者是在电话中向球员解释自己的计划，这有助于说服球员。比如在拜仁签下马兹拉维时，原本马兹拉维倾向加盟巴萨，但被纳帅说服，改变了想法。

不过纳格尔斯曼在拜仁如此大的权力也受到俱乐部队内工作人员的一些批评，如果纳帅没能带队成功，这样的批评声会更大。拜仁高层对纳格尔斯曼的要求不仅仅是获得冠军，而是为未来打造一支球队。

去年莱万的例子表明，拜仁高层并不会过多关注在俱乐部有着辉煌成绩的大牌球员。报道称，现在诺伊尔必须要接近教练，与教练谈判，并且在新的门将教练手下全力以赴，才能确定自己的未来。

纳格尔斯曼的权力要比诺伊尔大得多，但是纳帅也意识到一切都是变化的，如果输掉太多比赛，或者失去了球员的信任，他的情况就会非常危险。